计算近亲婚配的发病风险，主要基于孟德尔遗传定律以及特定遗传病的遗传模式和基因频率。以下是一般的计算思路：

1. 确定遗传病的遗传方式：首先要明确所涉及遗传病是常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X 连锁显性遗传、X 连锁隐性遗传还是多基因遗传等。

2. 计算基因频率：对于常染色体隐性遗传病，需要计算致病基因的频率（q）。假设群体处于遗传平衡状态，可通过患者频率（发病率）来估算基因频率。例如，常染色体隐性遗传病发病率为 1/10000，则致病基因频率 q = √1/10000 = 1/100。

3. 计算近亲婚配子代的发病风险：

对于一级亲属（如亲子、同胞）间的近亲婚配：

常染色体隐性遗传病：子代发病风险 = 1/4 × 亲缘系数 × 基因频率的平方。亲缘系数对于亲子或同胞为 1/2。

常染色体显性遗传病：只要双亲之一是患者，子代就有 1/2 的发病风险。

对于二级亲属（如叔侄、舅甥等）间的近亲婚配：

常染色体隐性遗传病：子代发病风险 = 1/8 × 亲缘系数 × 基因频率的平方。亲缘系数对于二级亲属为 1/4。

4. 考虑其他因素：实际计算中还可能需要考虑外显率、表现度等因素的影响。

例如，对于常染色体隐性遗传病，群体发病率为 1/10000，致病基因频率 q = 1/100，正常基因频率 p = 1 - q = 99/100。同胞间近亲婚配，亲缘系数为 1/2，子代发病风险 = 1/4 × 1/2 × (1/100)² = 1/800。

需要注意的是，实际情况可能更为复杂，具体的计算需要根据具体的遗传病类型和家族情况进行准确分析。